世界末日後的遙遠未來，從黑暗深處出現力量強大的部族，建立了一個前所未有的龐大帝國。 他們自稱異種知性體瑪士撒拉，但人類只以三個字稱呼他們：吸血鬼。 過去數百年，雖然人類與吸血鬼不斷戰爭，但亦有人希望雙方可以和平共處。 天主教神父亞伯．奈特羅德，受教皇廰任命保護人類安全。但亞伯本身並非人類，而是吸血鬼獵人，以吸取吸血鬼鮮血維持生命。亞伯遇上人類少女艾絲緹後，會否平息戰爭，改變人類與吸血鬼的命運？
Trinity Blood 照字面直譯是「三位一體之血」。在宗教角度來說，三位一體所指的是聖父、聖子和聖靈。作者引用了這個名詞，去借代筆下的角色。分別是該隱‧奈特羅德、亞伯‧奈特羅德和塞特‧奈特羅德三兄妹。該隱、亞伯和塞特亦是聖經中亞當和夏娃所生的三個兒子。相傳該隱殺死亞伯後，神把他放逐，使他變成了吸血鬼。神又憐憫亞伯被該隱殺死，在地上流血哀嚎七日七夜不止，許他以該隱的後代（吸血鬼）為食。
教廷巡行神父亞伯‧奈特羅德表面上是個冒失鬼，實際上卻是有「吸血鬼獵人」之稱的Ax派遣執行官，負責到不同地方調解吸血鬼事件。在這個黑暗混亂的時代，教廷和真人類帝國互相對峙，加上薔薇十字騎士團的惡意挑撥，亞伯可以維護「長生種」和「短生種」的共存嗎？為了贖罪而努力奮鬥的男子，心底有著難而磨滅的傷痕……
